咖啡風味特性在相同栽培管理條件下，高海拔栽培區有較佳表現，但臺灣咖啡產區多位於中低海拔，加上小農眾多，未建立標準化後製作業程序，常有不同批次咖啡品質不均問題，影響消費者購買意願及市場競爭力。

為提升後製加工品質及國產咖啡市場競爭力，農試所嘉義分所引進專業後製處理機械，例如咖啡果實色選機能快速篩選成熟的果實；脫皮機能分離果皮及生豆，減少瑕疵豆進入後續製程；果膠清洗機具高效率及減少水洗過程的人為汙染，省水效果達9成以上。

經採集北中南等中低海拔產地的咖啡果實，與臺灣咖啡策略聯盟合作，進行咖啡杯測品評，結果顯示一貫化製程的產品，穩定度達80分以上，屬精品咖啡等級，且分數普遍高於農民自行製作的產品。

農試所嘉義分所強調，一貫化後製處理設備除在製程中篩選果實成熟度，更提供穩定環境，兼具高效、省水、節能等優點，將是優化咖啡品質的新利器。