國內自從民國96年首次發現咖啡果小蠹危害蹤跡後，至今已入侵全國咖啡產區，為防制咖啡果小蠹對咖啡果實的侵害，農業部茶及飲料作物改良場制定綜合管理(IPM)的方法，以有效控制其族群蔓延。

    茶改場說明，咖啡果小蠹整個生活史均躲藏在咖啡的果實內，以鑽食進入咖啡果實，並於其中產卵及取食，受害的咖啡種子出現取食孔洞甚至發霉情形，成為精品咖啡豆所稱之物理性瑕疵，並造成後續選別之人力及時間成本額外耗損。此外，未剔除的蟲蛀豆會讓咖啡風味混濁，帶有酸味或酚味(藥水味)，嚴重影響咖啡品質。由於該害蟲躲藏於果實中的特性，使化學防治難以觸及蟲體，且因落果容易殘留於咖啡園中，造成害蟲族群持續發生，使產量減少及田間管理成本增加，嚴重影響咖啡整體產業發展。

    茶改場為使咖啡果小蠹銷聲匿跡，採用非化學農藥綜合管理措施防治技術，建議農友應掌握3個操作重點：

首先須清除孳生源(俗稱清園)，是非化學防治策略的重要基礎，培訓採收人力對被蛀果進行分撿，將被蛀果實移出咖啡園，避免果實掉落地面成為果小蠹孳生來源；採收末期需全面性移除枝條上所有未熟果、成熟果及乾果，移除果實的作業必須於修剪前完成，避免枝條夾帶的咖啡果實，成為果小蠹繁殖和躲避的處所，達到減少果小蠹族群數量及食物供應的目的。在施行主幹更新時，可於距地面30-50公分處鋸斷，藉此進行清園作業，有效阻斷害蟲食物及棲所的來源。

其次懸掛誘引器，茶改場於民國109年研發改良式誘引器，使田間操作更為簡便，利用等比例甲醇及乙醇混合做為誘引劑，使在果實外飛行之果小蠹雌成蟲受揮發物質吸引而被捕捉；設置誘引器同時具備監測功能，可以顯示園區蟲害危害高峰期及發生熱點，臺灣各產區普遍以3-5月能捕捉最多蟲體。

最後使用防治資材，因受限於現行未有核准防治咖啡果小蠹之化學藥劑，僅能應用植物性防治資材，如大蒜素、苦楝油、苦蔘鹼等，依商品的建議稀釋倍數施用於咖啡果實上，能減緩果實生長初期被害率的上升。

    茶改場指出，臺灣咖啡朝向精品化發展，除了設法突顯產區特色，更要有良好的原料供應，傳統粗放管理的概念也要與時俱進。該場與光電業者合作研發智慧選豆，減省篩選之人力成本，推薦農友多加利用。此外，茶改場綜合管理需要各種措施相輔相成，未來將持續投入輔導資源，辦理咖啡專業訓練講習，與農友共同交流實地經驗，一同努力建構咖啡產業價值鏈，生產出優質、安全的精品咖啡。