漁港主要提供漁船停泊，我國漁船停泊國內漁港係免收使用管理費，惟近年屢有長期未作業漁船滯留漁港占用泊位，影響作業漁船停泊及漁港調度，漁業署已於113年1月29日發布修正「農業部主管漁港基本設施使用管理費收費類目及費率」，針對未具有效漁業證照之漁船停泊漁港開始收費，同時推動老舊漁船限期自行解體延長汰建新船期限，以解決烏石、南方澳、正濱、八斗子、新竹、梧棲、安平、前鎮及東港鹽埔漁港等9處第一類漁港之泊位不足問題。

漁業署表示，為減少老舊漁船占用泊位，並提供船主有更充裕時間規劃漁船汰舊換新期程，漁業署於112年修正「漁船建造許可及漁業證照核發準則」，自112年至114年延長汰建新船年限，以鼓勵業者儘速完成解體漁船，112年由原本3年延長為15年，113年延長為12年，114年延長為9年，115年後恢復為3年。大幅增加漁民經營漁業彈性，並解決長期不作業漁船（筏）滯港問題，以使漁港提供作業漁船足夠停泊空間。

漁業署說明，本次修正收費類目及費率除針對未具有效漁業證照之漁船要收費外，對於漁船以外之船舶如遊艇、小船、客船、貨船、工作船均維持先前收費標準。

漁業署最後呼籲，漁船之漁業執照應保持有效狀態，至於短期內無經營漁業需求之業者，請儘快申請漁船解體，不僅可享有延長汰建年限，也可免繳交漁港使用管理費，可讓漁港使用空間更具彈性，以提供作業漁船充裕停泊空間，讓漁港功能發揮最大效能。